自1974年6月起，该同志正式参加工作，最初在吉林省通辽县角干公社青龙山大队下乡，成为一名知识青年，投身于基层劳动与锻炼。1976年12月，他应征入伍，在青岛海军基建工程兵十团服役，期间历任战士、班长、副排长等基层职务，后调至政治处担任书记及干事，积累了丰富的部队政治工作经验。1983年3月，他调至北京，在海军政治部保卫部担任干事，继续从事政治保卫相关工作。至1988年5月，他转业至国家土地管理局，先后担任局长秘书、综合处副处长及处长等职务，深入参与了土地管理领域的日常行政与综合协调工作。 1992年9月，他被任命为国家土地管理局政策法规司副司长，开始专注于土地政策与法律法规的研究制定。1994年2月，机构职能调整后，他转任国家土地管理局政策法规与监督检察司副司长，职责范围进一步拓展至监督检察领域。1996年5月，他担任国家土地管理局土地利用规划司司长，主导全国土地利用的规划与管理工作。1998年7月，随着国土资源部的组建，他出任该部地籍管理司司长，负责全国土地确权登记等地籍管理核心业务。 2000年12月，他调任国土资源部办公厅主任，全面主持部内日常运转、文电处理和综合协调工作。2002年7月，他被任命为国土资源部党组成员，同时继续兼任办公厅主任，进入部领导层。2005年12月，他晋升为国土资源部党组成员、副部长，开始承担更重要的领导职责；2006年10月，其副部长职务得以延续。2009年2月，他在担任党组成员、副部长的同时，兼任直属机关党委书记，负责部内党的建设与机关党务工作。2011年7月，他继续担任国土资源部党组成员、副部长，直至机构改革前夕。 2018年3月，他离开政府部门，转任全国政协提案委员会委员，利用其丰富的行政管理经验参与政协提案相关工作。此外，他还当选为第十三届全国政协委员，在参政议政平台上继续为国家发展建言献策。
二零一六年七月，根据国务院依照相关程序作出的国家工作人员职务任免决定，其中一项重要人事调整是免去了其当时担任的国土资源部副部长一职。此后，至二零一八年三月十五日，经全国政协相关会议审议通过，王世元被正式任命为中国人民政治协商会议全国委员会提案委员会委员，承担起新的工作职责。